Die Fluoreszenz-in-situ-Hybridisierung (FISH; auch Molekulare Zytogenetik) ist eine molekularzytogenetische Methode, mit der definierte Chromosomenbereiche angefärbt werden können. Sie ermöglicht den Nachweis und die Charakterisierung von numerischen und strukturellen Chromosomenveränderungen und wird ergänzend zur konventionellen Zytogenetik eingesetzt.

Der große Vorteil gegenüber der konventionellen Zytogenetik liegt darin, dass für die FISH-Diagnostik keine Zellteilung notwendig ist, da sie auch an Interphasen-Kernen durchgeführt werden kann. Desweiteren lassen sich auch kleine, sogenannte submikroskopische Veränderungen nachweisen, die unterhalb des Auflösungsbereichs der Chromosomenanalyse liegen.

Ein Nachteil ist allerdings, dass die FISH-Technik auf der Hybridisierung von DNA-Sonden beruht, die spezifische chromosomale Strukturen identifizieren. Somit kann die FISH-Methode nur über die Chromosomen bzw. Gene Auskunft geben, für die die Sonden eingesetzt wurden.

Für Verlaufskontrollen unter Therapie kann die FISH-Technik zur Detektion von Resterkrankung verwendet werden, sofern bei Erstdiagnose mittels Chromosomenanalyse eine Veränderung gefunden wurde, für deren Nachweis entsprechende FISH-Sonden zur Verfügung stehen. Die Sensitivität dieser Methode ist höher als bei der Chromosomenanalyse, jedoch deutlich geringer als bei der Polymerase-Ketten-Reaktion oder Durchflusszytometrie.