- Therapieversagen
- vor Beginn einer Clarithromycin enthaltenden Kombinationstherapie 

Einnahme von Magensäureblockern
Formalinspuren am Abnahmebesteck (mit NaCl-Lösung zwischenspülen)

Die Probennahme für die Kultur und Empfindlichkeitsprüfung von Helicobacter pylori sollte frühestens 4 Wochen nach Beendigung einer Eradikationstherapie erfolgen.
Antrum- und Korpus-Proben für die Mikrobiologie möglichst vor den Proben für histologische Untersuchungen entnehmen, um Formalin-Kontakt zu vermeiden (siehe Störfaktoren).
Das Biopsiematerial sollte mindestens stecknadelkopfgroß sein. 
Die Sensitivität der Untersuchung steigt aufgrund der fleckförmigen Dichteverteilung von 
Helicobacter pylori mit der Anzahl der Biopsien.